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Un diagnostic de sols, fondé sur la Science

Un diagnostic de sols, fondé sur la Science

Chez Genesis, nous plaçons la santé des sols au cœur de notre approche, car elle conditionne la résilience des écosystèmes agricoles et, par conséquent, la sécurisation des chaînes d’approvisionnement dont dépendent les entreprises. Elle constitue également le premier service rendu par l’agriculture régénérative.

Notre objectif est d’évaluer cette résilience à travers des indicateurs fiables, comparables et actionnables, capables de traduire la capacité d’un écosystème à se maintenir, s’adapter et se régénérer dans le temps — et de rendre visibles les effets des pratiques d’agriculture régénérative sur la performance et la robustesse des filières agricoles.

Mais comment mesurer la santé des sols à grande échelle, dans des contextes variés, et suivre son évolution dans le temps ?

Pour répondre à ces défis, nous avons développé une méthodologie scientifique rigoureuse, alignée avec les recommandations de la Directive Européenne de surveillance des sols. Cette approche est aujourd’hui déployée dans plus de 15 pays et sur plus de 200 000 hectares, avec le soutien de partenaires scientifiques reconnus (découvrir nos références).

Qu’est-ce que la santé d’un sol et comment la mesure-t-on ?

La santé d’un sol correspond à sa capacité à assurer ses fonctions essentielles : nourrir les plantes, stocker du carbone, retenir l’eau, héberger la biodiversité, et rester résilient face aux stress climatiques.

Pour traduire ces fonctions en données concrètes, nous réalisons des analyses physico-chimiques et biologiques du sol (texture, pH, matière organique, etc.) et suivons des indicateurs scientifiques, chacun reflétant un aspect clé du fonctionnement du sol :

  • Carbone

    Mesure la quantité de matière organique dans le sol. Indicateur clé de la fertilité, de la structure du sol et de sa capacité de stockage du carbone.

    Carbone

    Mesure la quantité de matière organique dans le sol. Indicateur clé de la fertilité, de la structure du sol et de sa capacité de stockage du carbone.

    Carbone

    Mesure la quantité de matière organique dans le sol. Indicateur clé de la fertilité, de la structure du sol et de sa capacité de stockage du carbone.

  • Biodiversité

    Quantifie le nombre microorganismes du sol, indicateur de la biodiversité et de l’activité du sol.

    Biodiversité

    Quantifie le nombre microorganismes du sol, indicateur de la biodiversité et de l’activité du sol.

    Biodiversité

    Quantifie le nombre microorganismes du sol, indicateur de la biodiversité et de l’activité du sol.

  • Eau

    Mesure la capacité du sol à retenir et restituer l’eau aux plantes.

    Eau

    Mesure la capacité du sol à retenir et restituer l’eau aux plantes.

    Eau

    Mesure la capacité du sol à retenir et restituer l’eau aux plantes.

  • Erosion

    Indique la sensibilité du sol à la perte de matière et de nutriments.

    Erosion

    Indique la sensibilité du sol à la perte de matière et de nutriments.

    Erosion

    Indique la sensibilité du sol à la perte de matière et de nutriments.

  • Pollution

    Evalue la présence de substances (éléments traces métalliques, salinisation, nitrates) pouvant altérer le fonctionnement naturel du sol et sa productivité.

    Pollution

    Evalue la présence de substances (éléments traces métalliques, salinisation, nitrates) pouvant altérer le fonctionnement naturel du sol et sa productivité.

    Pollution

    Evalue la présence de substances (éléments traces métalliques, salinisation, nitrates) pouvant altérer le fonctionnement naturel du sol et sa productivité.

Pour enrichir notre lecture des écosystèmes, nous intégrons également des données satellitaire (Sentinel-2), telles que la part d’habitats naturels, le couvert végétal ou la richesse de rotation des cultures.

Ces métriques, corrélées aux données de terrain, permettent un suivi à très grande échelle et une lecture enrichie des écosystèmes. Nous bénéficions pour cela du soutien de l’Agence Spatiale Européenne.

Comment mesurer la santé des sols à grande échelle, dans des contextes variés ?

Soil A

Total Organic Carbon

14.2

g/kg DM

Soil B

Total Organic Carbon

14.2

g/kg DM

Soil A

Total Organic Carbon

14.2

g/kg DM

Soil B

Total Organic Carbon

14.2

g/kg DM

Deux sols identiques sur le papier — avec les mêmes mesures brutes —ne fonctionnent pas de la même manière selon leur contexte (texture, climat, biome).

Pour tenir compte de cette variabilité, Genesis évalue chaque sol au sein de son cluster pédoclimatique — un regroupement de zones partageant des caractéristiques naturelles similaires de sol, climat, végétation.

Cette approche unique permet d’éviter les comparaisons biaisées entre deux parcelles et de distinguer :

  • ce qui relève du potentiel naturel du sol dans un contexte donné,

  • de ce qui relève des pratiques agricoles qui l’améliorent ou le dégradent.

Soil A

Soil Organic Carbon

14.2

g/kg DM

2 g/kg

12 g/kg

Soil B

Soil Organic Carbon

14.2

g/kg DM

13 g/kg

30 g/kg

Soil A

Soil Organic Carbon

14.2

g/kg DM

2 g/kg

12 g/kg

Soil B

Soil Organic Carbon

14.2

g/kg DM

13 g/kg

30 g/kg

Soil A

Total Organic Carbon

14.2

g/kg DM

Soil B

Total Organic Carbon

14.2

g/kg DM

Soil A

Total Organic Carbon

14.2

g/kg DM

Soil B

Total Organic Carbon

14.2

g/kg DM

Pour chaque cluster et pour chaque indicateur, Genesis définit des valeurs seuils:

  • valeur de référence – bon fonctionnement naturel,

  • valeur critique – état dégradé du sol,

  • zone intermédiaire – pour les états entre ces deux seuils.

Ces valeurs seuils servent à calibrer le niveau de fonctionnement réel d’un sol par rapport à ce qui est attendu dans son contexte naturel. Elles s’appuient sur la littérature scientifique, les réglementations, ou sur des modèles statistiques issus de données collectées à large échelle (+50 000 échantillons de sols intégrés à ce jour).

Grâce à ce calibrage, Genesis peut transformer pour chaque indicateur la valeur brute en notation de 0 à 10, adaptée au contexte spécifique local.

Soil A

Carbon score

7/10

GOOD

Soil B

Carbon score

3/10

DEGRADED

Soil A

Carbon score

7/10

GOOD

Soil B

Carbon score

3/10

DEGRADED

Soil A

Texture

Sandy

Climatic cluster

Asia-12

Soil B

Texture

Clayey

Climatic cluster

Europe-21

Soil A

Texture

Sandy

Climatic cluster

Asia-12

Soil B

Texture

Clayey

Climatic cluster

Europe-21

Observons quelques cas d'usages

Pour illustrer l’application de cette méthodologie à différentes sources de données brutes, nous avons travaillé sur deux exemples :

Diagnostic de santé des sols en France
Diagnostic de santé des sols en France
Diagnostic de santé des sols en France
Diagnostic du carbone des sols en Europe
Diagnostic du carbone des sols en Europe
Diagnostic du carbone des sols en Europe

Comment utiliser les mesures de santé sols pour piloter des filières agricoles et suivre leurs évolutions dans le temps ?

Pour faciliter la lecture et l’utilisation de nos mesures de santé des sols, nous avons développé le score de résilience Genesis, un indicateur agrégé allant de 0 à 10, conçu comme un outil de pilotage et un thermomètre de la santé des sols. Il permet de suivre la dynamique des sols dans le temps et de guider les décisions stratégiques et opérationnelles des entreprises et acteurs de terrain.

Cette note aggrège l’ensemble des indicateurs scientifiques nommés précédemment — carbone organique total, biomasse microbienne, pollution, érosion, réserve d’eau utilisable — sous la forme d’une moyenne géométrique pondérée. Sa construction repose sur l’expertise de nos spécialistes en sciences des sols.

Carbone

7.8

Eau

5.2

Biodiversité

8.3

Erosion

1.8

Pollution

6.5

6.5

Bon

0

10

Le score de résilience Genesis peut être vu comme un “Nutri‑Score” de la santé des sols. Il transforme une multitude de mesures complexes en une information simple et actionnable, qui permet de suivre la dynamique de la santé des sols au fil du temps, tout en restant ancré dans la rigueur scientifique des indicateurs individuels.

Comment se déroule un projet de notation des sols avec Genesis ?

Étape 1 — Échantillonnage représentatif

Chaque projet est accompagné d’une stratégie d’échantillonnage adaptée, selon les recommandations Verra Scope 3, GHGP, ISO 14064, ou aux besoins spécifiques de nos clients. La densité des prélèvements varie selon la typologie du projet.

Étape 1 — Échantillonnage représentatif

Chaque projet est accompagné d’une stratégie d’échantillonnage adaptée, selon les recommandations Verra Scope 3, GHGP, ISO 14064, ou aux besoins spécifiques de nos clients. La densité des prélèvements varie selon la typologie du projet.

Étape 1 — Échantillonnage représentatif

Chaque projet commence par une stratégie d'échantillonnage adaptée, conforme aux recommandations de Verra Scope 3, GHGP, ISO 14064, ou ajustée aux besoins spécifiques du client. Le nombre d'échantillons est adapté au type de projet.

Étape 2 — Mesures de terrain et analyses laboratoire

Les échantillons sont prélevés jusqu’à 30 cm selon le protocole de la FAO, puis sont analysés en laboratoire selon des procédures certifiées ISO. Cela assure la fiabilité des mesures et leur reproductibilité, quel que soit le contexte.

Étape 2 — Mesures de terrain et analyses laboratoire

Les échantillons sont prélevés jusqu’à 30 cm selon le protocole de la FAO, puis sont analysés en laboratoire selon des procédures certifiées ISO. Cela assure la fiabilité des mesures et leur reproductibilité, quel que soit le contexte.

Étape 2 — Mesures de terrain et analyses laboratoire

Les échantillons sont prélevés jusqu’à 30 cm selon le protocole de la FAO, puis sont analysés en laboratoire selon des procédures certifiées ISO. Cela assure la fiabilité des mesures et leur reproductibilité, quel que soit le contexte.

Étape 3 — Notation par indicateur

Chaque échantillon de sol est associé à son cluster pédoclimatique, et chaque indicateur reçoit une note de 0 à 10 selon sa performance par rapport aux seuils spécifiques du cluster. Cette notation traduit les mesures brutes en informations exploitables et comparables.

Étape 3 — Notation par indicateur

Chaque échantillon de sol est associé à son cluster pédoclimatique, et chaque indicateur reçoit une note de 0 à 10 selon sa performance par rapport aux seuils spécifiques du cluster. Cette notation traduit les mesures brutes en informations exploitables et comparables.

Étape 3 — Notation par indicateur

Chaque échantillon de sol est assigné à son groupe pédoclimatique et noté de 0 à 10 en fonction de sa performance par rapport aux seuils spécifiques du groupe. Cette notation transforme les mesures brutes en données exploitables et comparables pour chaque indicateur.

Étape 4 — Agrégation des résultats à différentes échelles

Les notes par indicateur sont ensuite agrégées pour produire des synthèses à plusieurs niveaux :

  • À l’échelle de la ferme : moyenne pondérée par la surface, sur l’ensemble des parcelles mesurées.

  • À l’échelle du projet : moyenne des fermes du projet.

  • À l’échelle de la filière : moyenne des fermes concernées.

  • Par mode de production : moyenne des fermes par mode de production.

Ces agrégations permettent de comparer et visualiser les performances à différentes échelles, facilitant le pilotage opérationnel.

Lors de cette étape, des redressements statistiques peuvent être appliqués pour que les résultats reflètent au mieux la réalité.

Étape 4 — Agrégation des résultats à différentes échelles

Les notes par indicateur sont ensuite agrégées pour produire des synthèses à plusieurs niveaux :

  • À l’échelle de la ferme : moyenne pondérée par la surface, sur l’ensemble des parcelles mesurées.

  • À l’échelle du projet : moyenne des fermes du projet.

  • À l’échelle de la filière : moyenne des fermes concernées.

  • Par mode de production : moyenne des fermes par mode de production.

Ces agrégations permettent de comparer et visualiser les performances à différentes échelles, facilitant le pilotage opérationnel.

Lors de cette étape, des redressements statistiques peuvent être appliqués pour que les résultats reflètent au mieux la réalité.

Étape 4 — Agrégation des résultats à différentes échelles

Les notes par indicateur sont ensuite agrégées pour produire des synthèses à plusieurs niveaux :

  • À l’échelle de la ferme : moyenne pondérée par la surface, sur l’ensemble des parcelles mesurées.

  • À l’échelle du projet : moyenne des fermes du projet.

  • À l’échelle de la filière : moyenne des fermes concernées.

  • Par mode de production : moyenne des fermes par mode de production.

Ces agrégations permettent de comparer et visualiser les performances à différentes échelles, facilitant le pilotage opérationnel.

Lors de cette étape, des redressements statistiques peuvent être appliqués pour que les résultats reflètent au mieux la réalité.

Étape 5 — Suivi dans le temps

Pour suivre la dynamique des sols, Genesis revient tous les 3 à 5 ans sur les mêmes parcelles, aux mêmes points GPS et à la même saison. Tous les indicateurs sont réévalués pour visualiser leurs évolutions, et quantifier ainsi l’impact des pratiques agricoles mises en place. Lors de cette étape, nous contrôlons la fiabilité des mesures en calculant la variance et l’écart-type des indicateurs, ainsi que la Minimum Detectable Difference (MDD), garantissant que les variations observées dans le temps sont significatives et comparables.

Étape 5 — Suivi dans le temps

Pour suivre la dynamique des sols, Genesis revient tous les 3 à 5 ans sur les mêmes parcelles, aux mêmes points GPS et à la même saison. Tous les indicateurs sont réévalués pour visualiser leurs évolutions, et quantifier ainsi l’impact des pratiques agricoles mises en place. Lors de cette étape, nous contrôlons la fiabilité des mesures en calculant la variance et l’écart-type des indicateurs, ainsi que la Minimum Detectable Difference (MDD), garantissant que les variations observées dans le temps sont significatives et comparables.

Étape 5 — Suivi dans le temps

Pour suivre la dynamique des sols, Genesis retourne sur les mêmes parcelles tous les 3 à 5 ans, aux mêmes points GPS et à la même saison. Tous les indicateurs sont réévalués pour visualiser les changements et quantifier l'impact des pratiques agricoles mises en œuvre.

Au cours de cette étape, nous vérifions la fiabilité des mesures en calculant la Différence Minimale Détectable (DMD), afin de garantir que les changements observés au fil du temps sont significatifs et comparables.